Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM21P19474 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms