Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms