Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNNI3P19429 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNI3P19429 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms