Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LBPP18428 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LBPP18428 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LBPP18428 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LBPP18428 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms