Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms