Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A1P13866 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A1P13866 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms