Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms