Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM10L2BP0DMW5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms