Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms