Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBP08949 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBP08949 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMBP08949 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMBP08949 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMBP08949 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMBP08949 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMBP08949 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBP08949 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBP08949 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBP08949 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBP08949 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBP08949 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBP08949 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBP08949 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms