Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms