Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TYMSP04818 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TYMSP04818 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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