Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD74P04233 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD74P04233 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD74P04233 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD74P04233 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD74P04233 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD74P04233 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD74P04233 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD74P04233 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD74P04233 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD74P04233 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD74P04233 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD74P04233 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD74P04233 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD74P04233 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD74P04233 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD74P04233 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms