Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD1O95696 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD1O95696 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD1O95696 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD1O95696 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD1O95696 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD1O95696 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms