Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB6O95452 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB6O95452 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB6O95452 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms