Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KA4O75676 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA4O75676 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms