Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN5O75503 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN5O75503 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN5O75503 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms