Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPAG9O60271 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPAG9O60271 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPAG9O60271 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPAG9O60271 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPAG9O60271 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPAG9O60271 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPAG9O60271 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPAG9O60271 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms