Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms