Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms