Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNPHO15079 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNPHO15079 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNPHO15079 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNPHO15079 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNPHO15079 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNPHO15079 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNPHO15079 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNPHO15079 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNPHO15079 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNPHO15079 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms