Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SYNMO15061 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SYNMO15061 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SYNMO15061 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNMO15061 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNMO15061 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNMO15061 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNMO15061 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNMO15061 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNMO15061 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNMO15061 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNMO15061 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNMO15061 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNMO15061 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNMO15061 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNMO15061 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNMO15061 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNMO15061 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNMO15061 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNMO15061 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNMO15061 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNMO15061 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNMO15061 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNMO15061 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNMO15061 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNMO15061 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNMO15061 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNMO15061 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNMO15061 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNMO15061 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNMO15061 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNMO15061 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms