Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IKBKBO14920 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IKBKBO14920 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
IKBKBO14920 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IKBKBO14920 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms