Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCTN6O00399 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms