Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BQV1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BQV1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQV1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H3BQV1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms