Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATL2C9JE40 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATL2C9JE40 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms