Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms