Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms