Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A6NL46 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A6NL46 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A6NL46 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms