Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SERINC4A6NH21 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms