Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms