Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC78A2IDD5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms