Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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