Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM13A-212ENST00000508369 3169 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP17-201ENST00000289968 3461 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH7-201ENST00000339553 3459 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPPE-202ENST00000416695 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GPATCH2-201ENST00000366934 3218 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCD4-206ENST00000450993 3232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 UBXN10-201ENST00000375099 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 EGFR-211ENST00000638463 4735 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008555.2-202ENST00000601776 5302 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS18-201ENST00000220509 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 C16orf62-201ENST00000251143 3894 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 C16orf62-203ENST00000438132 3855 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MORC2-201ENST00000215862 4469 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAF3IP2-207ENST00000368761 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V0A1-205ENST00000544137 3047 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LPA-202ENST00000447678 1839 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM196-201ENST00000405764 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN10A-201ENST00000449082 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ASTN1-202ENST00000361833 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0141-202ENST00000432126 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TNXB-203ENST00000451343 3125 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF43-203ENST00000577716 4367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM1-201ENST00000333756 3795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GAPVD1-204ENST00000394083 4747 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC37BP1-203ENST00000417404 4742 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 WISP1-202ENST00000250160 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CRIP3-201ENST00000274990 800 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PRG3-201ENST00000287143 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV1-36-201ENST00000390301 393 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MYL6BP1-201ENST00000429485 615 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01716-202ENST00000437350 298 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOBP1-201ENST00000447693 357 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012307.1-201ENST00000449242 197 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099681.1-201ENST00000454777 552 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018695.1-201ENST00000484096 664 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC136628.1-201ENST00000503218 561 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01606-206ENST00000520929 411 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV7-1-201ENST00000547918 380 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008013.3-201ENST00000605711 675 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL008726.1-201ENST00000607703 569 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.140-201ENST00000613842 252 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087645.3-201ENST00000624708 587 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091953.1-201ENST00000624775 296 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AK2-214ENST00000626911 160 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TARS-216ENST00000627006 171 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010507.2-201ENST00000632795 676 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PRICKLE2-204ENST00000564377 8032 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ABLIM1-204ENST00000369256 3203 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PAK6-201ENST00000260404 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 COL3A1-202ENST00000317840 3873 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MID1-203ENST00000380780 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AP1G1-202ENST00000393512 3593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNB2-201ENST00000523207 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP1-214ENST00000577119 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K14-202ENST00000376926 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms