Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms