Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRPRBQ9Y5M8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms