Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG4BQ9Y4P1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG4BQ9Y4P1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms