Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
DCAF1Q9Y4B6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DCAF1Q9Y4B6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms