Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC2Q9Y235 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC2Q9Y235 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms