Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AMFRQ9UKV5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms