Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO3Q9UK99 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms