Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD3Q9UJU5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms