Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATPIF1Q9UII2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATPIF1Q9UII2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms