Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA9Q9UGM1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms