Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLKQ9UBT6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms