Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPZ2Q9P299 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms