Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms