Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMOD2Q9NZR1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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