Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6AQ9NYA3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms