Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP4R2Q9NY27 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP4R2Q9NY27 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms